.cram Extensión de archivo
Tipo de archivo Compressed Alignment File
| Desarrollador | EBI |
| Categoría | Archivos de información |
| Formato | Binary |
¿Para qué son los archivos CRAM?
Formato de archivo de alineación comprimido desarrollado por el EBI, una estación externa del Laboratorio Europeo de Biología Molecular; almacena alineaciones de lecturas de secuencias cortas de ADN generadas por alineadores de lecturas cortas como BWA, BBMap y BLAT.
El formato de archivo CRAM es similar al formato de archivo Binary Alignment/Map (BAM) pero presenta una mejor compresión de archivos y un formato de contenedor binario reestructurado orientado a columnas. A medida que los volúmenes de datos aumentan en el campo del software genético, el formato CRAM fue diseñado para reducir la huella de disco de los datos de alineación.
La alineación de lecturas cortas es el proceso de descifrar de dónde procede una secuencia en el genoma. Esto puede ser difícil ya que el genoma de referencia es bastante grande y no siempre se buscan coincidencias exactas en el genoma de referencia. Los alineadores de lecturas cortas se utilizan para buscar secuencias enormes en busca de coincidencias y casi coincidencias. Dado que las secuencias son tan grandes, la compresión proporcionada por formatos como el CRAM es necesaria para mantener los tamaños de los archivos manejables.
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